2024年3月27日,皇冠hg0086客户端王科嘉团队在血液与肿瘤学Top期刊《Journal of Hematology & Oncology》上发表题为《Identification of SARS-CoV-2-specific T cell and its receptor》的最新研究成果。
在新型冠状病毒大流行期间,由于病毒毒株不断变异,接种疫苗产生的中和抗体对机体的保护能力大大下降。病毒进入机体后,T细胞可通过T细胞受体(TCR)靶向识别抗原,发挥细胞免疫保护作用。目前为止,对于新冠病毒的T细胞研究主要集中于特异性T细胞的特征描述上,而对于其TCR的靶向识别少有关注。本研究围绕新冠病毒特异性TCR识别这一关键问题,建立起新冠病毒TCR组库预测模型,筛选出能够识别新冠病毒抗原的TCR序列,并制备TCR-T工程细胞,阐明TCR对于新冠病毒抗原的精准识别过程。
该研究首先收集了新冠急性期、恢复期、康复期、疫苗接种、健康人群的TCR免疫组库数据,通过分析发现,新冠病毒感染后会导致TCR克隆型、多样性增加,并且疫苗接种人群与新冠人群TCR组库相似度高。随后搭建基于TCR组库机器学习模型,用于区分健康人或新冠感染人群,准确率达95.7%。其次,本研究收集新冠疫苗接种人群外周血单个核细胞样本,利用特异性抗原肽刺激,分选出特异性T细胞并进行TCR测序,通过DLpTCR预测筛选获得高亲和力TCR,构建出TCR-T工程细胞,通过共培养证实特异性TCR对新冠抗原的靶向识别能力。此外,我们还利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组库测序(IR-seq)和流式细胞仪等方法监测新冠鼻喷疫苗诱导肺部免疫细胞活化情况,结果表明鼻内接种疫苗可诱导肺组织内T 细胞活化、组织驻留记忆T细胞(Trm)生成和TCR克隆扩增,增强机体长效免疫保护作用。综上所述,该研究揭示了新冠感染后特异性T细胞演进与功能,阐明TCR对新冠病毒抗原表位的靶向识别机制,通过TCR-T的方式拓展T细胞的精准识别在病毒感染中的应用。
皇冠hg0086客户端王科嘉教授为本论文的通讯作者,皇冠hg0086客户端21级博士生张茜、助理教授梁青、皇冠附属翔安医院主治医师张睿、21级硕士生王楠为本论文的共同第一作者。该工作还受到了皇冠信息学院俞容山教授团队的支持,同时得到国家自然科学基金、教育部科技领军人才团队项目、福建省自然科学基金以及皇冠校长基金等资助。
王科嘉教授,博士生导师,国家优秀青年科学基金获得者。长期从事免疫组学与T细胞领域研究。以通讯作者在国际知名学术期刊(Cell,Hepatology,Journal of Hematology & Oncology等)发表多篇论文。热忱欢迎优秀博士后加盟,同时欢迎优秀学子报考皇冠hg0086客户端王科嘉课题组研究生。联系方式:wangkejia@xmu.edu.cn
全文链接:https://doi.org/10.1186/s13045-024-01537-6